Hôpitaux : la super bactérie qui inonde le monde hospitalier, résiste à tout

Encore un danger de plus, une possible pandémie ? Avec cette super bactérie qui sort d’on ne sait où et qui prolifère à l’échelle mondiale, l’inquiétude est de mise.

Dans plusieurs régions d’Europe, certaines souches de la dernière super bactérie résistent déjà à tous les antibiotiques connus et les chercheurs ne savent pas encore comment elle se propage à l’échelle internationale.

Lorsque le Dr Jean Lee est tombé sur le cas d’une patiente par ailleurs en bonne santé et gravement atteinte d’une infection contractée à l’hôpital en 2012, elle savait qu’elle devait enquêter davantage.

Le Dr Lee, qui travaillait comme registraire des maladies infectieuses dans un hôpital de Melbourne, s’est inquiété lorsque le patient a eu des complications suite à une procédure élective relativement simple.

«Il aurait dû être hospitalisé rapidement», dit-elle. « Mais au lieu de cela, il a contracté une infection très résistante et a dû rester à l’hôpital pendant plus de deux mois, suivi d’une rééducation. »

Il s’est avéré qu’il avait contracté le Staphylococcus epidermidis ( S. epidermidis ), une bactérie présente sur la peau humaine et l’une des causes les plus fréquentes des infections associées aux hôpitaux.

Il n’a pas été considéré auparavant comme une préoccupation majeure, les médecins s’inquiétant davantage des autres bactéries super résistantes aux antibiotiques, comme son Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM), plus connu sous le nom de staphylocoque doré.

Mais, comme l’a découvert le Dr Lee, S. epidermidis devient résistant à la plupart des antibiotiques et, peut-être le plus inquiétant, dans certaines régions d’Europe, certaines souches résistent déjà à tous les antibiotiques connus.

«Les autres insectes sont plus mortels, et nous avons tous un bug sur notre peau, alors je pense qu’il y a une perception que ce n’est pas si grave et que lorsqu’un patient se contracte, nous pouvons y faire face», explique le Dr Lee.

« Mais nous avons découvert que la résistance est telle que certains de ces cas sont pratiquement impossibles à traiter. »

Après avoir découvert que S. epidermidis était à l’origine de l’infection de sa patiente , le Dr Lee a entamé un projet de six ans avec son consultant et directeur de thèse, le professeur Ben Howden, pour comprendre l’étendue de sa résistance. Leurs résultats ont maintenant été publiés dans Nature Microbiology.

Ils ont identifié trois souches de bactéries devenues résistantes aux deux antibiotiques distincts actuellement utilisés pour traiter les infections: la rifampicine et la vancomycine.

Le professeur Howden, qui reste clinicien et directeur du laboratoire de santé publique de l’unité de diagnostic microbiologique de l’institut Doherty, dit que cette résistance est préoccupante parce que la vancomycine en particulier est utilisée comme dernière ligne de défense contre les infections.

«Les directives actuelles concernant ces types d’infections recommandent un traitement combiné à base de rifampicine et de vancomycine, qui n’ont aucun lien entre elles et devraient se protéger les unes les autres», explique le professeur Howden.

«Mais cette découverte révèle que la résistance à un antibiotique provoque une résistance chez l’autre, suscitant des inquiétudes quant aux directives thérapeutiques actuelles.

 

 

« Il a également réussi à se répandre malgré le bon contrôle des infections actuellement en place dans les hôpitaux des pays développés, ce qui a aidé à gérer le staphylocoque doré. »

Le Dr Lee et le professeur Howden ont d’abord établi que les souches résistantes étaient présentes dans les hôpitaux de Victoria, puis ont élargi leur recherche pour déterminer où elles pouvaient être trouvées.

Ils ont examiné des centaines de cas de S. epidermidis provenant de 78 institutions dans dix pays du monde entier et ont constaté qu’ils se sont répandus dans le monde entier.

«Nous avons travaillé avec des centres de référence au Royaume-Uni, en Europe et en Amérique», déclare le Dr Lee. «Ces centres sont difficiles à soigner ou ont des problèmes inhabituels dans les laboratoires des hôpitaux. Nous avons découvert ces trois nouvelles souches dans des cas difficiles à traiter chez des personnes totalement indépendantes.

« Lorsque nous avons vu les infections présentant le même schéma de résistance aux antibiotiques, nous avons réalisé que les nouvelles souches résistantes étaient partout. »

Les chercheurs ont utilisé toute la technologie de séquençage du génome disponible à l’Institut Doherty pour séquencer rapidement le code génétique complet de la bactérie.

«Cela signifiait que nous pouvions comparer nos échantillons internationaux à un niveau génétique pour voir comment ils étaient liés», explique le professeur Howden. « Nous avons trouvé les mêmes mutations rendant les bogues très résistants aux antibiotiques dans tous les pays que nous avons testés. »

Les patients ont tendance à contracter une infection à S. epidermidis lorsqu’ils ont un objet étranger, comme une ligne pour administrer un médicament ou un cathéter, insérés. Parce que le virus n’est pas particulièrement virulent, les patients infectés ont également tendance à être immunodéprimés.

«Lorsque vous brisez la peau, vous fournissez un portail d’entrée pour le virus, donc une infection nécessite généralement quelque chose qui n’appartient pas au corps», explique le Dr Lee. « La punaise crée une couche protectrice autour de tout ce qui a été inséré, ce qui lui permet d’éviter les antibiotiques et la réponse immunitaire de l’organisme. »

Selon le professeur Howden, il est fréquent chez les patients en soins intensifs, car ils ont tendance à avoir autant de lignées insérées, ce qui a probablement contribué à la propagation des souches résistantes.

 

«Les cathéters et autres dispositifs implantés sont fréquemment imprégnés d’antibiotiques en tant que stratégie pour prévenir l’infection, mais cette approche peut favoriser le développement d’une résistance», explique le professeur Howden.

« En outre, ces infections sont plus fréquentes dans les soins intensifs, où les patients sont les plus malades et les antibiotiques puissants sont largement prescrits, favorisant le développement d’une résistance supplémentaire. »

Alors que les chercheurs disent que ces nouvelles souches de S. epidermidissont probablement acquises uniquement en milieu hospitalier, elles ne savent pas encore comment elles se propagent à l’échelle internationale.

«Comme beaucoup de domaines scientifiques, cette découverte a soulevé beaucoup de nouvelles questions», explique le Dr Lee.

«L’un des plus pressants est de déterminer exactement comment le virus est transmis aux patients. Connaître le mécanisme nous aidera à comprendre comment il se répand à l’échelle internationale.

« Nous devons également comprendre tous les résultats cliniques – quelle est la résistance aux antibiotiques contribuant à de mauvais résultats et que peut-on faire pour y remédier? »

L’une des premières tâches consiste à réviser les directives de traitement.

«Nous savons que ce que nous faisons actuellement ne fait que renforcer la résistance», explique le professeur Howden. «Il est donc urgent de réfléchir à ce que nous devrions recommander.

«Il est urgent de mettre en place un système de surveillance international pour comprendre la prévalence et l’impact de S. epidermidis et pour mesurer systématiquement la résistance aux antibiotiques et les infections dues à ce pathogène.»